O LAMMOC atua em diversas linhas de pesquisa como: modelagem e monitoramento atmosférico, modelagem hidrológica, desastres ambientais, desenvolvimento de tecnologias em monitoramento ambiental de baixo custo, entre outras.

Atualmente as principais linhas de pesquisa do LAMMOC são:

• Modelagem chuva-vazão;
• Bloqueios atmosféricos;
• Modelagem atmosférica nas escalas de tempo e clima;
• Fontes de energias limpas;
• Instrumentação de baixo custo.